142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3714 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 
493 aa  1001    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  56.83 
 
 
501 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  56.59 
 
 
500 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  57.17 
 
 
507 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  58.3 
 
 
494 aa  570  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  57.17 
 
 
507 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  59.34 
 
 
494 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  56.88 
 
 
498 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  55.35 
 
 
495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  54.53 
 
 
501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  57.06 
 
 
508 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  53.75 
 
 
509 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  57.85 
 
 
517 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  55.49 
 
 
539 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  55.44 
 
 
508 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  57 
 
 
498 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  55.26 
 
 
502 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  52.87 
 
 
500 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  56.38 
 
 
501 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  56.58 
 
 
502 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  55.74 
 
 
510 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  53.29 
 
 
497 aa  541  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  56.58 
 
 
502 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  55.76 
 
 
502 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  56.29 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  55.85 
 
 
526 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  55.69 
 
 
498 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  56.6 
 
 
499 aa  531  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  54.44 
 
 
523 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  54.17 
 
 
500 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  53.29 
 
 
519 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  54.37 
 
 
500 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  52.75 
 
 
497 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  53.96 
 
 
500 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  53.81 
 
 
502 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  54.03 
 
 
523 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  53.75 
 
 
500 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  52.33 
 
 
492 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  56.29 
 
 
497 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  53.75 
 
 
500 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  53.96 
 
 
500 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  53.96 
 
 
500 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  53.96 
 
 
500 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  53.96 
 
 
500 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  54.41 
 
 
516 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  54.41 
 
 
516 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  54.41 
 
 
516 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  54.17 
 
 
488 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  54.73 
 
 
510 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1908  malate/quinone oxidoreductase  57.92 
 
 
495 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.266658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  53.8 
 
 
561 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  52.36 
 
 
508 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  53.29 
 
 
500 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  56.08 
 
 
510 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  52.41 
 
 
552 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  52.77 
 
 
525 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  53.09 
 
 
518 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0816  malate:quinone oxidoreductase  55.11 
 
 
496 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720849  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  51.06 
 
 
492 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  51.06 
 
 
492 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  53.91 
 
 
548 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  53.7 
 
 
548 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  51.93 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  53.47 
 
 
518 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
548 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  51.11 
 
 
492 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  50.41 
 
 
553 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  51.02 
 
 
560 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  51.79 
 
 
503 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  51.02 
 
 
547 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  50.41 
 
 
553 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  50.41 
 
 
553 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  52.22 
 
 
540 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  50.41 
 
 
547 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  50.92 
 
 
523 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  48.37 
 
 
499 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  48.66 
 
 
498 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  50.2 
 
 
551 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  51.23 
 
 
519 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  51.51 
 
 
497 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  52.47 
 
 
492 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  49.9 
 
 
527 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2629  malate:quinone oxidoreductase  48.37 
 
 
498 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.765647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2683  malate:quinone oxidoreductase  48.37 
 
 
498 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  51.32 
 
 
576 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  50.3 
 
 
571 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20971  malate:quinone oxidoreductase  53.78 
 
 
496 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  51.74 
 
 
568 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  51.53 
 
 
550 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  51.74 
 
 
550 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  50.6 
 
 
549 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1584  malate:quinone oxidoreductase  53.14 
 
 
502 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  47.43 
 
 
507 aa  483  1e-135  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  49.9 
 
 
527 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>