228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3078 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3078  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 356 aa  703    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0545755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1660  AFG1-family ATPase  59.54 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000156302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1667  AFG1 family ATPase  59.54 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7388  AFG1-family ATPase  61 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1581  AFG1-family ATPase  60.53 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23980  predicted ATPase  58.94 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669926  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16620  predicted ATPase  57.86 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10730  predicted ATPase  60.12 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2272  AFG1-family ATPase  56.72 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1346  AFG1-like ATPase  58.24 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1899  AFG1-family ATPase  56.05 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3912  AFG1 family ATPase  54.47 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0771393  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3542  AFG1-family ATPase  58.06 
 
 		 333 aa  359  5e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000203163  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1883  AFG1-family ATPase  58.14 
 
 		 358 aa  358  8e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.927457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12685  hypothetical protein  54.7 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000506976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2220  AFG1-like ATPase  55.16 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2266  AFG1 family ATPase  55.16 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2209  AFG1 family ATPase  55.16 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13800  predicted ATPase  55.56 
 
 		 353 aa  352  8e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.908748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2491  AFG1 family ATPase  53.89 
 
 		 345 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1740  AFG1-family ATPase  58.33 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1388  AFG1-family ATPase  52.56 
 
 		 352 aa  339  5e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.629214  normal  0.139105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1968  AFG1-family ATPase  59.28 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  decreased coverage  0.0000116257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2019  AFG1-like protein ATPase  44.76 
 
 		 350 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.842851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0149  AFG1-family ATPase  40.41 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.842308  normal  0.156894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  28.03 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.35 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  28.35 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  28.35 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  28.35 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  28.04 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  26.75 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  32.39 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  27.73 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  27.4 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  27.73 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  30.58 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1096  AFG1 family ATPase  28 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  25.87 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  26.47 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  26.79 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  25.94 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  27.41 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  27.44 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  25.87 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  27.41 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  27.44 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  27.44 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  26.35 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  25.82 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  27.67 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  32.34 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  26.05 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  24.93 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  25.07 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  25.73 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  25.55 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  25.55 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  31.9 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  25.62 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  25.94 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  25.75 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  26.53 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  27.74 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  24.63 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  25.45 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  25.87 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  32.04 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  24.78 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  25.56 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  25.85 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  26.5 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  25.76 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  26.69 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  23.42 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  25.67 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  28.22 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  26.73 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  33.96 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  26.67 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  26.76 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  27.71 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  27.23 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  30.73 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  26.69 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  26.01 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  27.07 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  27.07 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  27.07 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  27.69 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  27.11 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  25.07 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  26.96 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  30.21 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  25.51 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  25.51 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  27.65 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  25.68 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  31.51 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  27.07 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>