36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2355 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  74.34 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4367  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  47.65 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 159 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  38.41 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.81 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.97 
 
 		 318 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 141 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  24.17 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 134 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>