More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1850 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  100 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  55.46 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  50.88 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  52.17 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  56.88 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  47.27 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  43.24 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2050  response regulator receiver protein  60.19 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000730652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  46.73 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  44.35 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  44.35 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  44.86 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  44.55 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  44.55 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  46.36 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  44.14 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  41.82 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 474 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  39.82 
 
 		 1197 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  39.25 
 
 		 122 aa  87.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  39.82 
 
 		 1127 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 806 aa  87  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 120 aa  87  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  42.57 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  44.86 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  37.61 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 762 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  38.94 
 
 		 1127 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  43.56 
 
 		 122 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 122 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 1370 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  38.97 
 
 		 445 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 122 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.34 
 
 		 763 aa  84.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  44.33 
 
 		 752 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1611 aa  84  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  41.44 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  38.32 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 1002 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  44 
 
 		 734 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 1193 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  41.07 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>