41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1094 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  56.38 
 
 
661 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  100 
 
 
674 aa  1312    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  53.58 
 
 
648 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  54.68 
 
 
655 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  53.83 
 
 
648 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  52.28 
 
 
662 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  51.65 
 
 
665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  52.34 
 
 
653 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  51.5 
 
 
665 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  51.5 
 
 
665 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  52.28 
 
 
665 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  51.83 
 
 
658 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  51.13 
 
 
668 aa  582  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  50.75 
 
 
663 aa  575  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  50.15 
 
 
667 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  51.35 
 
 
664 aa  569  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  52.61 
 
 
672 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  52.45 
 
 
647 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  51 
 
 
646 aa  551  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  49.47 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  49.24 
 
 
667 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  48.78 
 
 
670 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  46.59 
 
 
654 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  33.48 
 
 
680 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  34.63 
 
 
648 aa  253  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  35.08 
 
 
366 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  35.21 
 
 
415 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 
365 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  33.68 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  29.77 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  28.3 
 
 
366 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  30.48 
 
 
338 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  29.67 
 
 
367 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  28.27 
 
 
372 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 
382 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 
406 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  27.61 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  30.18 
 
 
407 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  33.56 
 
 
689 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  32.39 
 
 
650 aa  49.3  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  25.95 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>