27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1503 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1612    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  26.51 
 
 		 792 aa  201  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  23.97 
 
 		 771 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  24.72 
 
 		 767 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  24.6 
 
 		 818 aa  179  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  23.67 
 
 		 771 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  24.57 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  24.66 
 
 		 753 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  22.81 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  22.43 
 
 		 803 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  21.77 
 
 		 776 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  25.73 
 
 		 722 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  21.35 
 
 		 757 aa  95.5  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.26 
 
 		 743 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  22.37 
 
 		 746 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  23.7 
 
 		 717 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  26.88 
 
 		 643 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  22.9 
 
 		 721 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  22.86 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4596  hypothetical protein  31.31 
 
 		 728 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  31.91 
 
 		 710 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  33.77 
 
 		 878 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  22.22 
 
 		 869 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  32.41 
 
 		 881 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  26.06 
 
 		 144 aa  44.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  29.14 
 
 		 833 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  38.03 
 
 		 895 aa  44.3  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>