More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3240 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3240  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
302 aa  589  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206902  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  42.25 
 
 
311 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  42.64 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  41.09 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  41.09 
 
 
311 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  41.86 
 
 
311 aa  188  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  41.86 
 
 
311 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  41.86 
 
 
311 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  41.8 
 
 
311 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  41.8 
 
 
311 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  40.7 
 
 
311 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  41.8 
 
 
311 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  41.8 
 
 
311 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  41.09 
 
 
311 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  41.09 
 
 
311 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  38.64 
 
 
315 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.47 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.7 
 
 
342 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  37.42 
 
 
311 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.63 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  41.09 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  41.25 
 
 
313 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.03 
 
 
335 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  36.36 
 
 
310 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.5 
 
 
313 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  38.01 
 
 
323 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.39 
 
 
341 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.6 
 
 
311 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.2 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.64 
 
 
341 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.13 
 
 
357 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.97 
 
 
318 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  36.1 
 
 
312 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  36.6 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.45 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.45 
 
 
322 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  37.22 
 
 
318 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.54 
 
 
350 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  37.88 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  38.67 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 
350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.88 
 
 
350 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.47 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.47 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  35.96 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.38 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  37.18 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  37.18 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  37.18 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  37.5 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.95 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  35.74 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  39.38 
 
 
311 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.66 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  36.5 
 
 
335 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  37.55 
 
 
318 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.2 
 
 
317 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.09 
 
 
311 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  38.28 
 
 
312 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.01 
 
 
314 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.34 
 
 
314 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  33.22 
 
 
317 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0083  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.32 
 
 
313 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  37.18 
 
 
318 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  38.52 
 
 
316 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  37.55 
 
 
318 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  37.18 
 
 
318 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  38.78 
 
 
351 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  36.82 
 
 
318 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  38.76 
 
 
316 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.05 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  34.92 
 
 
328 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.3 
 
 
312 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.04 
 
 
341 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  37.34 
 
 
320 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.29 
 
 
321 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  35.58 
 
 
314 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.1 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.43 
 
 
314 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.69 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.92 
 
 
308 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.33 
 
 
306 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.47 
 
 
316 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  33.96 
 
 
355 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6062  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.64 
 
 
310 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1461  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  33.33 
 
 
303 aa  148  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.6 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.36 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  33.6 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1927  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.7 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  40.16 
 
 
313 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0102  ribonucleoside hydrolase RihC  35.23 
 
 
302 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000159714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.13 
 
 
318 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  33.58 
 
 
356 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  34.8 
 
 
306 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  34.54 
 
 
310 aa  142  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.6 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  35.96 
 
 
306 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  35.96 
 
 
306 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>