40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0211 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  100 
 
 
741 aa  1460    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  34.31 
 
 
3333 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  34.63 
 
 
1937 aa  131  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  34.69 
 
 
1064 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  32.89 
 
 
1467 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  32.31 
 
 
2267 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  32.03 
 
 
1013 aa  107  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  35.54 
 
 
578 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
4855 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  30 
 
 
1977 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  34.23 
 
 
1419 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  35.42 
 
 
2716 aa  90.5  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  35.74 
 
 
691 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  31.17 
 
 
1672 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.49 
 
 
2744 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.96 
 
 
1637 aa  64.7  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.23 
 
 
1710 aa  64.3  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  33.95 
 
 
454 aa  61.2  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  28.44 
 
 
1181 aa  55.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.88 
 
 
759 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0492  hypothetical protein  25.58 
 
 
884 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  33.33 
 
 
715 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.65 
 
 
808 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.25 
 
 
1004 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2314  Protein of unknown function DUF1628  38.52 
 
 
527 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.561661  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  26 
 
 
1855 aa  51.2  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  25 
 
 
729 aa  50.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  27.33 
 
 
576 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2141  hypothetical protein  36.05 
 
 
1165 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.515545  normal  0.041224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0478  hypothetical protein  38.75 
 
 
519 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  28.72 
 
 
991 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.53 
 
 
1081 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  29.1 
 
 
2334 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 
1489 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  28.57 
 
 
1003 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
803 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.63 
 
 
1137 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3088  hypothetical protein  27.65 
 
 
233 aa  45.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3343  hypothetical protein  35 
 
 
786 aa  44.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0061  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 
1039 aa  43.9  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.221236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>