12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3343 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3343  hypothetical protein  100 
 
 
786 aa  1521    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  32.18 
 
 
741 aa  61.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  42.25 
 
 
1374 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2141  hypothetical protein  43.42 
 
 
1165 aa  54.3  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.515545  normal  0.041224 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3088  hypothetical protein  31.45 
 
 
233 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1770  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  28.92 
 
 
735 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0271319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  34.41 
 
 
1161 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0015  hypothetical protein  25.82 
 
 
531 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0181047  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3214  hypothetical protein  38.89 
 
 
447 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0061  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
1039 aa  45.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.221236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  38.82 
 
 
266 aa  44.3  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0268  S-layer-related protein  38.46 
 
 
867 aa  44.3  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>