16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2314 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2314  Protein of unknown function DUF1628  100 
 
 
527 aa  1006    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.561661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  36.73 
 
 
1374 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  36.36 
 
 
1064 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  37.76 
 
 
1578 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  33.08 
 
 
729 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3744  hypothetical protein  35.62 
 
 
416 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  38.52 
 
 
741 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
1489 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  40.21 
 
 
1194 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
794 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 
1710 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  36.9 
 
 
1298 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  37.04 
 
 
2267 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.83 
 
 
1008 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.18 
 
 
2182 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  38.89 
 
 
592 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.679089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>