32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3893 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  75.97 
 
 
154 aa  248  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  50 
 
 
154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  46.41 
 
 
152 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  41.56 
 
 
160 aa  107  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  42.67 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  36.71 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  40.26 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  34.97 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  31.21 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  31.54 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  46.15 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  45.9 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  29.05 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  31.82 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  45.1 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  42.31 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  47.06 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  40 
 
 
135 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  42.22 
 
 
173 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  43.48 
 
 
146 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  41.86 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  36.36 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  31.82 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  43.9 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  39.58 
 
 
133 aa  42  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  40.91 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  40.98 
 
 
132 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  43.18 
 
 
131 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  32.97 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  44.19 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>