30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2550 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  100 
 
 		 117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  90.6 
 
 		 117 aa  217  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  78.26 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  75.21 
 
 		 117 aa  181  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  74.78 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  57.39 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  53.39 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  53.91 
 
 		 121 aa  129  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  54.78 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  50.86 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  50.43 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  50.86 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  48.7 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  47.46 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  46.9 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  50.44 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 120 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  39.66 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  37.93 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  41.59 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  39.66 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  36.89 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  42.11 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  35.83 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  29.06 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  29.66 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>