49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1340 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 386 aa  754    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  69.03 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.01 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.59 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.91 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  37.6 
 
 		 253 aa  132  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  35.85 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 255 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.07 
 
 		 238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 244 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  32.55 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.25 
 
 		 221 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  26.67 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.95 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  23.53 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  25 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.14 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.35 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.35 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.93 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.82 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  28.09 
 
 		 245 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  26.28 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  26.33 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  37.33 
 
 		 254 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.37 
 
 		 287 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.57 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  30.67 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.97 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.32 
 
 		 273 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.46 
 
 		 202 aa  46.2  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  25.09 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.18 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.72 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  32.86 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  31.03 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  25.45 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.77 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  36.11 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36 
 
 		 222 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  21.89 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.26 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  34.72 
 
 		 273 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>