44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0554 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  100 
 
 
78 aa  157  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  78.21 
 
 
78 aa  137  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  74.03 
 
 
86 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  62.34 
 
 
94 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  61.04 
 
 
86 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  59.74 
 
 
105 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  59.74 
 
 
87 aa  100  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  61.04 
 
 
114 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  57.33 
 
 
79 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  56.41 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  55.26 
 
 
84 aa  86.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  57.89 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  52.56 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  51.28 
 
 
82 aa  77  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  40.26 
 
 
309 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 
284 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  41.03 
 
 
225 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.62 
 
 
398 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  35.9 
 
 
317 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  34.21 
 
 
223 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  32.43 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  31.18 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  34.21 
 
 
217 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 
223 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  34.88 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  41.03 
 
 
264 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35.9 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1608  glutaredoxin  35.9 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0528934  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.93 
 
 
384 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.76 
 
 
391 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  41.33 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  31.65 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  36.76 
 
 
402 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  35.53 
 
 
80 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  38.96 
 
 
263 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  38.96 
 
 
263 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  30.38 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.35 
 
 
383 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  31.17 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  38.98 
 
 
442 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  26.58 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>