More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15070 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15070  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.748877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  30.69 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  29.7 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  31.82 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  28.71 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  29.13 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  33.66 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  29.41 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  27.45 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  27.45 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  29.41 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  27.45 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  27.88 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  32.22 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  32.95 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  32.35 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  35.56 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  35.56 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  32.26 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  32.22 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.35 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  30 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  29.7 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  28.43 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  30.1 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  27.72 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.7 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  26.92 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  29.81 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  31.25 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  34.15 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  26.92 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  27.72 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  26 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  32 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  30.23 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  26.73 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  26.73 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  30.69 
 
 
108 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  27.45 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  29.07 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  30.23 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  32.35 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  26 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  29.7 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  27.18 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  29.07 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  28.71 
 
 
110 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  29.07 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  31.68 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  29.07 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  29.07 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  27.18 
 
 
106 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  27.88 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  27.27 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  31.48 
 
 
277 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  27.91 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  27.18 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  25.24 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  27.45 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  27.72 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  29.41 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  28.3 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  28.3 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  27.88 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  30.3 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  35.23 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  27.27 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  29.41 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  28 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  30.34 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  28.43 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  31.68 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  31.18 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  28 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>