34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5203 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  100 
 
 		 1057 aa  2092    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.82 
 
 		 887 aa  389  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.54 
 
 		 911 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.55 
 
 		 860 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  27.84 
 
 		 816 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.4 
 
 		 834 aa  288  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.71 
 
 		 862 aa  280  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.51 
 
 		 829 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  27.88 
 
 		 823 aa  275  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.61 
 
 		 863 aa  267  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  25.11 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.26 
 
 		 837 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 		 852 aa  254  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.9 
 
 		 885 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.47 
 
 		 850 aa  250  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  25.85 
 
 		 858 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  29.29 
 
 		 871 aa  247  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.91 
 
 		 848 aa  238  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.6 
 
 		 845 aa  230  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.5 
 
 		 848 aa  229  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.55 
 
 		 831 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  26.65 
 
 		 840 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  23.65 
 
 		 923 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  21.02 
 
 		 983 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.09 
 
 		 923 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.15 
 
 		 874 aa  89.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  23.42 
 
 		 906 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  25.39 
 
 		 932 aa  81.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  24.62 
 
 		 931 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.65 
 
 		 942 aa  75.1  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.9 
 
 		 910 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.85 
 
 		 526 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.21 
 
 		 615 aa  51.6  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.84 
 
 		 506 aa  48.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>