53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4134 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  34.97 
 
 
158 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  35.04 
 
 
159 aa  97.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  35.37 
 
 
160 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  35.82 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  35.07 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  38.17 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  36.6 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  38.17 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  32 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  31.94 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  36.36 
 
 
158 aa  91.3  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  33.58 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  36.64 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  29.22 
 
 
153 aa  84.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  34.85 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  31.01 
 
 
244 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  30.38 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  36.7 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  33.67 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  35.4 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  30.41 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  35.04 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  31.93 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  29.05 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  26.39 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  28.89 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  26.06 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  31.11 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  29.53 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  32.17 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  31.34 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  32.09 
 
 
148 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4161  hypothetical protein  29.2 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4019  hypothetical protein  29.93 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4135  hypothetical protein  29.2 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  24.81 
 
 
180 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>