88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2921 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2921  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
326 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0331  protein of unknown function DUF1568  32.44 
 
 
297 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0320  protein of unknown function DUF1568  32.43 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  31.68 
 
 
297 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  31.33 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  30.46 
 
 
298 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  30.98 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3872  hypothetical protein  29.24 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4133  hypothetical protein  29.21 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0220  hypothetical protein  33.72 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3990  hypothetical protein  28.28 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1788  hypothetical protein  30.82 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.239361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  30.3 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3257  hypothetical protein  28.9 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1717  hypothetical protein  30.48 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  30.05 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2323  hypothetical protein  41.84 
 
 
129 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0887847  normal  0.0112234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  29.82 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  27.44 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  30.34 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  29.66 
 
 
241 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  31.78 
 
 
234 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  25.53 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  23.57 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  23.4 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.21 
 
 
224 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.39 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 
221 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  29.1 
 
 
235 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  29.46 
 
 
199 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  26.62 
 
 
241 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  30.22 
 
 
234 aa  53.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  31.78 
 
 
260 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  30.84 
 
 
222 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  31.78 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  26.97 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  28.89 
 
 
234 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  22.06 
 
 
461 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  29.37 
 
 
277 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  26.03 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  30.72 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  27.47 
 
 
232 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  30.95 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  29.13 
 
 
164 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  27.1 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  27.59 
 
 
216 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  25.84 
 
 
230 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  26.95 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  27.78 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  29.08 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  29.9 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  26.51 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  26.51 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  26.43 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  25.55 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  27.66 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  27.07 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  25.9 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  25.24 
 
 
228 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  27.66 
 
 
282 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29611  hypothetical protein  28.35 
 
 
124 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  25.56 
 
 
239 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  30 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  26.56 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  27.1 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  24.16 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  30.85 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  29.76 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25.75 
 
 
174 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  24.38 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  26.95 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  25.82 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  27.69 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  24.82 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  30.94 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  25.24 
 
 
252 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  24.63 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  25.16 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  25.47 
 
 
178 aa  43.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  28.45 
 
 
222 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  34.07 
 
 
158 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  25.93 
 
 
258 aa  43.1  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  33.65 
 
 
214 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>