35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2313 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2313  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 406 aa  816    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0409  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.8 
 
 		 290 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  0.0713633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.79 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.782983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0792  membrane protein  27.22 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000106  metal-dependent hydrolase  29.39 
 
 		 288 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05711  hypothetical protein  31.69 
 
 		 287 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  51.72 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  43.1 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  49.18 
 
 		 246 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  54.17 
 
 		 214 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  55.77 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5111  hypothetical protein  46.94 
 
 		 89 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0927764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  50 
 
 		 227 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  45.16 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  49.02 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6887  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  53.85 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  50 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  56.82 
 
 		 250 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  48.08 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  47.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  44.44 
 
 		 241 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  44.44 
 
 		 227 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  45.83 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  46.67 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  45.83 
 
 		 214 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.83 
 
 		 226 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  45.83 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  39.24 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  45.83 
 
 		 241 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  48.94 
 
 		 321 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  48.94 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  37.21 
 
 		 242 aa  43.1  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>