More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3452 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  73.62 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  64.17 
 
 		 255 aa  334  7e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  66.14 
 
 		 255 aa  331  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  41.6 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  36.86 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  42 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  38.25 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 287 aa  168  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  34.9 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  37.65 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  37.7 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.11 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  38.4 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.74 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  37.65 
 
 		 352 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.66 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  36.36 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  37.11 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  37.11 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  35.97 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  39.77 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0223  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00787996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.98 
 
 		 286 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  35.86 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  35.46 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  35.86 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  35.16 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  36.47 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4289  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2838  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  38.65 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2591  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318671  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  37.4 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 364 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.74 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.73 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.71 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  36.29 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  35.83 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0569  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  38.52 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  37.6 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  37.05 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  38.13 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  37.69 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  38.04 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  38.89 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0491  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 		 345 aa  158  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  35.97 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1456  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  35.97 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.497855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>