30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2583 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  86.96 
 
 		 115 aa  213  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  31.87 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  30 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  25.35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  28.09 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  33.96 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  27.63 
 
 		 120 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 292 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  26.47 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>