49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2116 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 104 aa  206  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  43.27 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.39 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  45.65 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  40.24 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  47.46 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  34.07 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  31.03 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  38.36 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  39.73 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.5 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  32.53 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  38.36 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.1 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  38.36 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  34.44 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  31.33 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  36.62 
 
 		 375 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  29.55 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  40.98 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  35.14 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  32.76 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  30 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  30.34 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  31.03 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1820  hypothetical protein  34.57 
 
 		 101 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  43.86 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  32.43 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  32.43 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  32.43 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  32.43 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  28.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  31.03 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.77 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.84 
 
 		 98 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  34.62 
 
 		 94 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>