240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4738 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  51.6 
 
 
200 aa  177  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  47.64 
 
 
201 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  41.67 
 
 
207 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  39.78 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  37.64 
 
 
207 aa  94.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  34.97 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  34.09 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  40.12 
 
 
209 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  37.04 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  34.78 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  34.62 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  34.68 
 
 
207 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  33.54 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  33.14 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  31.35 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  36.36 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  34.13 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  33.14 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  32.32 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  34.46 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  32.57 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  30 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  30.36 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.9 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  32.67 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  29.89 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  32.32 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  34.06 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  32.12 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  29.41 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  30.11 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  31.46 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  31.79 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  30.49 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  31.97 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  33.33 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  26.55 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  29.27 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  29.88 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  33.12 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  33.12 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  33.76 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  33.12 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  26.26 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  32.67 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  31.95 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  31.07 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  31.02 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  30.71 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  25.14 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  28.74 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  34.23 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  31.79 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  28.74 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  32.73 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  34.88 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  35.5 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  32.3 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  30.57 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  29.27 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  32.02 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  31.05 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  31.58 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  28.57 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  31.33 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  30.43 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  28.66 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  28.66 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  25.14 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  25.14 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  32.89 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  25.14 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  32.12 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  30.53 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  25.7 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>