26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1905 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  884    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  30.73 
 
 		 408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  30.14 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  30.32 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4871  hypothetical protein  28.76 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186059  normal  0.150101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  30.08 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  23.34 
 
 		 982 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  30.08 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  26.58 
 
 		 286 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  30.5 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  23.11 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.92 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  25.78 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  25.31 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 1001 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1620  hypothetical protein  26.39 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  26.11 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  24.01 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  25.15 
 
 		 553 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  25.41 
 
 		 268 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>