More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1214 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0699  valyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 987 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2790  valyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 994 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1989  valyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 987 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1214  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 990 aa  2036    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1334  valyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 977 aa  1009    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3087  valyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 987 aa  635  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.705018  normal  0.448197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 957 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 952 aa  625  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0983  valyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 948 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4240  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 948 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 972 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 968 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 930 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 882 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 877 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 926 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1674  valyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 947 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2331  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 1030 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748917  normal  0.908682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 984 aa  592  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3477  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 1029 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 872 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 947 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 947 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1468  valyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 893 aa  574  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2683  valyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 947 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1706  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 1031 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.987588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 984 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 885 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 887 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 886 aa  529  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 874 aa  525  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 865 aa  522  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 887 aa  522  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 879 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 865 aa  522  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 888 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 880 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 888 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 881 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 882 aa  515  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 882 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 897 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 886 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 880 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 874 aa  503  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 879 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33832  predicted protein  33.96 
 
 		 1056 aa  505  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 881 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 880 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 883 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 885 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 886 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 884 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 883 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01880  valine-tRNA ligase, putative  32 
 
 		 1109 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 929 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 883 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 867 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 881 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 883 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 881 aa  489  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 883 aa  489  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 892 aa  489  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 895 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 884 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 892 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 891 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 883 aa  479  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 881 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 866 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1076  valyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 873 aa  474  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 880 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 880 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 883 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 880 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 880 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 874 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0966  valyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 873 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 880 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0737  valyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 875 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 909 aa  469  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 879 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2450  valyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 887 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 872 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 909 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 891 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 882 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2073  valyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 888 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0484  valyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 925 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.762053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 922 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 917 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 909 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 888 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1335  valyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 876 aa  457  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 921 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 1006 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 917 aa  458  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 921 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 1002 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>