28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1746 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  38.24 
 
 		 377 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  42.61 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  40.17 
 
 		 190 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  37.69 
 
 		 447 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  38.52 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  36.75 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  38.69 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  40.31 
 
 		 180 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  37.31 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  37.96 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  35.34 
 
 		 374 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  35.34 
 
 		 374 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  42.48 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  41.13 
 
 		 168 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  37.96 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  31.25 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  40 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  31.25 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  32.56 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  37.3 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  38.39 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  36.5 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  36.5 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  39.82 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  31.2 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  24.07 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>