104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3544 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  71.78 
 
 		 287 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  71.02 
 
 		 282 aa  390  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  71.02 
 
 		 282 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  63.77 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  58.91 
 
 		 280 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  61.66 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  60.78 
 
 		 288 aa  325  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  60 
 
 		 281 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  56.57 
 
 		 294 aa  316  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  51.37 
 
 		 293 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  51.7 
 
 		 284 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  53.79 
 
 		 358 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  50 
 
 		 273 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 		 274 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  49.06 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.2 
 
 		 277 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.27 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  46.93 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  47.92 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  47.92 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  47.92 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  49.06 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  46.3 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.91 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  46.92 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  45.53 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  47.27 
 
 		 275 aa  238  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  45.82 
 
 		 272 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  44.66 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  46.21 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  50 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  43.77 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  43.75 
 
 		 274 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.09 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  43.73 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  46.95 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  44.32 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  44.8 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  45.83 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  44.36 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  46.22 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  46.56 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  44.53 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  43.84 
 
 		 276 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  45 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.83 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  48.8 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  45.66 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  47.52 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  43.94 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  43.11 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  43.43 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  44.36 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  45.35 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  45.34 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  43.21 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  46.77 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  45.67 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.16 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.12 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  44.22 
 
 		 325 aa  222  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  44.66 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  43.55 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  44.24 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  40.07 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  43.3 
 
 		 636 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  47.15 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  42.09 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  46.34 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  39.79 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  43.15 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  41.3 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  42.8 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  45.93 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  42.71 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  43.93 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  43.93 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  41.38 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  40 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  42.12 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  42.68 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  36.06 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  42.54 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  41.29 
 
 		 334 aa  175  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  35.14 
 
 		 359 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.83 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.24 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2399  ABC-type tungstate transport system, permease component  35.16 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000226996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.06 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1482  tungstate ABC transporter permease  34.2 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0301515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>