104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2093 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  84.15 
 
 		 282 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  83.1 
 
 		 282 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  67.66 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  69.5 
 
 		 273 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  53.52 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  53.88 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  48.08 
 
 		 301 aa  254  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  47.15 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  48.67 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  49.59 
 
 		 278 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  47.45 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  49.79 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  45.8 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  48.85 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  48.85 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  49.59 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  49.59 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  49.59 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  48.77 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  48.46 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  50.41 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  50.41 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  47.84 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  45.32 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  50.41 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  49.18 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  46.44 
 
 		 282 aa  244  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  49.21 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  48.77 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  48.77 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  48.77 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  44.78 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  48.36 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  45.96 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  49.15 
 
 		 358 aa  241  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  46.09 
 
 		 274 aa  241  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  48.99 
 
 		 272 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  44.66 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  45.22 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  47.93 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  49.02 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.72 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  46.35 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  44.91 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  46.86 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  46.95 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.77 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.67 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  45.56 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  43.28 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  45.93 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  47.54 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  48.78 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  43.06 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.57 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  49.36 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  47.11 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  45.97 
 
 		 297 aa  221  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  44.44 
 
 		 288 aa  221  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.15 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.6 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  46.81 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  49.19 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  44.26 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  43.82 
 
 		 280 aa  214  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  45.97 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.07 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  44.74 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.84 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  41.89 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  44.4 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  41.53 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  42.57 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  46.19 
 
 		 314 aa  194  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  43.92 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  42.51 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  39.92 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  39.22 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  39.51 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  40.08 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  36.47 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  39.85 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  41.5 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  39.37 
 
 		 636 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  35.34 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  42.23 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  37.45 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  36.89 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  42.17 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  41.77 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  33.75 
 
 		 359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.34 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  31.8 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3706  molybdate or tungstate transport  30.68 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.33 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.61 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>