104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0039 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  58.01 
 
 		 284 aa  331  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  56.94 
 
 		 283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  40 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  41.7 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  39.41 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  35 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  38.24 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  35.68 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  36.43 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  34.26 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  38.84 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  37.55 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  38.3 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  35.36 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.45 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  35.1 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 		 636 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  37.28 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  37.45 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  36.4 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  37.45 
 
 		 274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  32.98 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 274 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.83 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.36 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  36.93 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.08 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.09 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.28 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  32.48 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  36.84 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  34.17 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  36.1 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  32.59 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  31.6 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  34.5 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  34.01 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  39.06 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  33.45 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  33.19 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  35.68 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  33.62 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  30.51 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  31.62 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  36.45 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  32.34 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  35.86 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  34.16 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  31.29 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  34.51 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  34.8 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  32.5 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  29.22 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  36.15 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  33.74 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  32.61 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  31.34 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  32.61 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  34.45 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  32.17 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  30.62 
 
 		 359 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  32.72 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  33.88 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  33.33 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  28.63 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  31.1 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  30.26 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  35.08 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  30.23 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  32.08 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2399  ABC-type tungstate transport system, permease component  27.84 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000226996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>