104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3917 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  72.06 
 
 
274 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  72.06 
 
 
274 aa  408  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  73.9 
 
 
270 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  72.06 
 
 
274 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  71.69 
 
 
274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  71.79 
 
 
274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  71.79 
 
 
274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  71.79 
 
 
274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  71.32 
 
 
274 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  71.06 
 
 
274 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  71.53 
 
 
270 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  71.9 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  72.43 
 
 
270 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  71.17 
 
 
270 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  53.87 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  55.39 
 
 
273 aa  308  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  53.03 
 
 
272 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  53.03 
 
 
272 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  53.76 
 
 
275 aa  299  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  50.55 
 
 
273 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  49.08 
 
 
284 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  48.98 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  48.73 
 
 
269 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  50.17 
 
 
301 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  49.62 
 
 
269 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  50.41 
 
 
280 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  48.2 
 
 
282 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  47.84 
 
 
282 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  44.24 
 
 
283 aa  235  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.75 
 
 
285 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 
294 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  47.68 
 
 
278 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.7 
 
 
275 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  47.13 
 
 
272 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  42.16 
 
 
268 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  44.03 
 
 
301 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  44.78 
 
 
274 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  47.54 
 
 
300 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  44.72 
 
 
274 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  44.53 
 
 
287 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  44.77 
 
 
275 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  43.97 
 
 
280 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  46.22 
 
 
275 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  46.75 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  47.56 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  46.72 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  44.86 
 
 
278 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.11 
 
 
279 aa  218  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
290 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  43.07 
 
 
276 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  43.8 
 
 
282 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  43.8 
 
 
274 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  42.59 
 
 
282 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  44.35 
 
 
286 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  45.83 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  44.78 
 
 
358 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.48 
 
 
282 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  45.16 
 
 
314 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  46.01 
 
 
307 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.88 
 
 
277 aa  208  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  42.86 
 
 
288 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  42.42 
 
 
282 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  43.9 
 
 
297 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  44.94 
 
 
294 aa  205  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  43.8 
 
 
274 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  45.3 
 
 
316 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.64 
 
 
273 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  44.76 
 
 
312 aa  201  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  43.98 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  40.22 
 
 
325 aa  198  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  40.08 
 
 
318 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.83 
 
 
272 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  39.64 
 
 
293 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.44 
 
 
271 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  40.78 
 
 
308 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  39.33 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  39.26 
 
 
274 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  42.97 
 
 
309 aa  182  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  42.37 
 
 
314 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  37.45 
 
 
293 aa  178  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  41.04 
 
 
304 aa  176  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  37.4 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  37.09 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  39.67 
 
 
269 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  39.67 
 
 
269 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  39.26 
 
 
269 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  39.92 
 
 
334 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  35.06 
 
 
307 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  36.14 
 
 
636 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.57 
 
 
283 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  36.63 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  35.93 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.06 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.5 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2399  ABC-type tungstate transport system, permease component  28.26 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000226996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>