104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1815 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  70.63 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  75.1 
 
 		 278 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  74 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  70.55 
 
 		 278 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  66.19 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  69.81 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  71.32 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  63.14 
 
 		 274 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  69.92 
 
 		 272 aa  358  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  65.06 
 
 		 286 aa  348  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  63.24 
 
 		 275 aa  348  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  62.5 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  66 
 
 		 275 aa  342  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  65.34 
 
 		 281 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  61.42 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  69.55 
 
 		 271 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  62.6 
 
 		 274 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  63.93 
 
 		 249 aa  326  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  58.33 
 
 		 276 aa  321  8e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  52.27 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  50.57 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  47.15 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  46.59 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  49.79 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.31 
 
 		 275 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  48.53 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  45.49 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  45.35 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  44.19 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.26 
 
 		 273 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  44.19 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  44.4 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  44.67 
 
 		 290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  45.56 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  43.84 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  45.08 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.21 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  44.16 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  43.18 
 
 		 270 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 274 aa  224  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 270 aa  225  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  47.68 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  44.1 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  44.4 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.18 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.24 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  43.18 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.65 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  42.81 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  42.55 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  42.59 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  41.45 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  41.82 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.53 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  40.7 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.53 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  42.02 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  44.17 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  43.75 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  39.86 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  40.59 
 
 		 316 aa  191  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  42.68 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  43.5 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  41.73 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  40.71 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  37.41 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  39.84 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  35.29 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  37.92 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  37.6 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  36.76 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  36.73 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  38.18 
 
 		 636 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  36.33 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  36.33 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  32.12 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  38 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  38.1 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  37.3 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  34.07 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  37.25 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.46 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.37 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.27 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2399  ABC-type tungstate transport system, permease component  29.75 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000226996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>