104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2631 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.72 
 
 
271 aa  349  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  58.33 
 
 
272 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.71 
 
 
273 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.26 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  51.42 
 
 
269 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  51.01 
 
 
269 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  51.42 
 
 
269 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  50.57 
 
 
273 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  48.92 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  48.56 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  47.46 
 
 
276 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  48.2 
 
 
285 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  44.49 
 
 
274 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  45.79 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  44.64 
 
 
273 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  48 
 
 
281 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  44.69 
 
 
275 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.21 
 
 
279 aa  238  9e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  43.8 
 
 
275 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  47.66 
 
 
275 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 
275 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  42.65 
 
 
274 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  46.07 
 
 
301 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  46.01 
 
 
288 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  48.28 
 
 
300 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  45.14 
 
 
294 aa  234  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  46.57 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  45.85 
 
 
282 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  45.85 
 
 
282 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  44.52 
 
 
287 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  46.4 
 
 
284 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  44.13 
 
 
278 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  44.84 
 
 
275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  42.8 
 
 
288 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  42.12 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  43.59 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  43.59 
 
 
274 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  40.98 
 
 
268 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  43.59 
 
 
274 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  43.09 
 
 
278 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  42.6 
 
 
280 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  43.4 
 
 
273 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  43.59 
 
 
274 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
274 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  43.82 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  43.91 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  42.64 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  41.24 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  40.66 
 
 
282 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 
274 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  41.69 
 
 
301 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 
270 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  42.4 
 
 
282 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  41.88 
 
 
280 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  41.67 
 
 
249 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  41.95 
 
 
286 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  40.22 
 
 
282 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  40.88 
 
 
274 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 
271 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  44.31 
 
 
312 aa  205  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 
270 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 
274 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  40.99 
 
 
358 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  42.38 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  44.21 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  45.04 
 
 
307 aa  199  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  43.72 
 
 
293 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  38.28 
 
 
312 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  39.31 
 
 
297 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  37.86 
 
 
308 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  41.32 
 
 
316 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  41.04 
 
 
318 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  42.15 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  39.55 
 
 
636 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  36.16 
 
 
273 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  38.67 
 
 
325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  38.1 
 
 
274 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  39.37 
 
 
284 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  36.4 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  40.16 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  38.93 
 
 
304 aa  170  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  38.67 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  38.41 
 
 
293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.68 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.38 
 
 
284 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  33.07 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.36 
 
 
288 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  31.73 
 
 
272 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3706  molybdate or tungstate transport  29.71 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.520064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>