103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2399 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2399  ABC-type tungstate transport system, permease component  100 
 
 
297 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000226996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1482  tungstate ABC transporter permease  50.36 
 
 
296 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0301515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  35.16 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50710  ABC type tungstate transporter, permease component  37.11 
 
 
297 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  34.8 
 
 
280 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  31.4 
 
 
274 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  33.33 
 
 
287 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  35.62 
 
 
282 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  34.76 
 
 
282 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4646  hypothetical protein  30.7 
 
 
291 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  32.03 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
281 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  31.87 
 
 
273 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  30.71 
 
 
358 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  31.25 
 
 
318 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
283 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  29.23 
 
 
293 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  30.11 
 
 
284 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  28.26 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  29.89 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
270 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
274 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
274 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
274 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  28.69 
 
 
274 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  28.92 
 
 
281 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
274 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  30.25 
 
 
314 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
269 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
270 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  32.03 
 
 
275 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  27.5 
 
 
280 aa  99  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  29.1 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  31.56 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  31.22 
 
 
278 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  31.8 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
272 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  30.86 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  28.93 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  26.57 
 
 
270 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  29.75 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  28.9 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
297 aa  92.4  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  25.09 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  32.17 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  29.29 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  30.86 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  26.16 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  27.69 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.76 
 
 
279 aa  89  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  26.3 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.84 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  29.07 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  30.11 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  26.99 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  25.86 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  29.29 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.8 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  26.09 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
636 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  26.89 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  28.16 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.52 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  23.99 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  25.37 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  24.15 
 
 
359 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  23.88 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  25.82 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.1 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  23.18 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.79 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  24.67 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  25.11 
 
 
269 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.57 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  24.15 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3706  molybdate or tungstate transport  27.54 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  24.23 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>