44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2754 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1213    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  49.33 
 
 		 597 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 553 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  39.21 
 
 		 576 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  35.1 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  26.98 
 
 		 645 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  24.48 
 
 		 867 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 229 aa  107  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  30.45 
 
 		 232 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  30.86 
 
 		 240 aa  97.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 363 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  33.49 
 
 		 254 aa  93.6  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  33.05 
 
 		 279 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  29.27 
 
 		 264 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  27.55 
 
 		 367 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  33.47 
 
 		 226 aa  90.5  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  32.27 
 
 		 270 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  35.64 
 
 		 245 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  32.72 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  28.91 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  27.64 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  24.38 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  27.76 
 
 		 263 aa  67  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  25.62 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  26.34 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  27.24 
 
 		 1196 aa  60.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  23.48 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  29.28 
 
 		 1916 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 1848 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1284 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.28 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  24.08 
 
 		 658 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.05 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  24.27 
 
 		 930 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  23.04 
 
 		 480 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 331 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.05 
 
 		 426 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.43 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  22.94 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  24.46 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  24.07 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0533  cytochrome c family protein, putative  29.92 
 
 		 134 aa  43.5  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00012786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>