41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1537 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  830    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  22.47 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.91 
 
 
1433 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.24 
 
 
1426 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.7 
 
 
1420 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  22.83 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.11 
 
 
1415 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  26.86 
 
 
1428 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.33 
 
 
1584 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  22.76 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  20.3 
 
 
1503 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  21.93 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  23.89 
 
 
1500 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.31 
 
 
1434 aa  59.7  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  28.57 
 
 
1461 aa  59.7  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  22.13 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  20.31 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  21.84 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  22.94 
 
 
1661 aa  58.2  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.53 
 
 
1411 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  20 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  21.9 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  23.53 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.36 
 
 
1431 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.01 
 
 
1406 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  18.92 
 
 
1415 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  20.27 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  20.87 
 
 
1436 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.22 
 
 
1424 aa  50.1  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  25.35 
 
 
1416 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.69 
 
 
1414 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  23.15 
 
 
1578 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  18.67 
 
 
1415 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  25.35 
 
 
421 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  25.35 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  20.57 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  20.45 
 
 
1647 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  19.41 
 
 
716 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.78 
 
 
1563 aa  46.2  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  21.13 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  19.68 
 
 
361 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>