More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2332 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  64.51 
 
 		 595 aa  638    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 602 aa  1158    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  61.37 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  59.39 
 
 		 613 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  59.41 
 
 		 612 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  61.55 
 
 		 605 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  60.33 
 
 		 614 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  57.27 
 
 		 628 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  57.12 
 
 		 646 aa  582  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  55.7 
 
 		 620 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  57.64 
 
 		 624 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  49.29 
 
 		 579 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  46.07 
 
 		 593 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  46.28 
 
 		 595 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  44.23 
 
 		 596 aa  353  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  39.59 
 
 		 588 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  37.75 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  39.8 
 
 		 588 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  42.54 
 
 		 595 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  41.02 
 
 		 586 aa  326  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  39.59 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.18 
 
 		 581 aa  321  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  38.06 
 
 		 584 aa  320  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 		 594 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  36.86 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  36.68 
 
 		 580 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  37.04 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  36.68 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36.68 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36.68 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  36.68 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  42.4 
 
 		 601 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  41.7 
 
 		 588 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  38.78 
 
 		 577 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  36.81 
 
 		 580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  36.68 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  37.23 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  37.85 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.51 
 
 		 586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  38.34 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 556 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  39.53 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 		 576 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 		 586 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  36.75 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  37.93 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  37.9 
 
 		 577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  36.86 
 
 		 576 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36 
 
 		 580 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.18 
 
 		 580 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.18 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 		 599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  38.05 
 
 		 581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.96 
 
 		 619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  39.11 
 
 		 583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  37.01 
 
 		 589 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  34.62 
 
 		 617 aa  301  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 		 604 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  37.14 
 
 		 589 aa  299  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  39.43 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  38.66 
 
 		 587 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  40.73 
 
 		 575 aa  298  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  37.47 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  37.73 
 
 		 624 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  36.41 
 
 		 606 aa  293  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.45 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  36.09 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  38.39 
 
 		 576 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  33.63 
 
 		 645 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  37.08 
 
 		 625 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.45 
 
 		 645 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  39.25 
 
 		 610 aa  290  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  34.95 
 
 		 599 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  34.81 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  40.29 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  37.1 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  36.69 
 
 		 578 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  36.69 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  36.69 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  36.67 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  36.69 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  39.82 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  37.63 
 
 		 623 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  35.41 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  37.63 
 
 		 623 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  37.83 
 
 		 606 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.48 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  34.81 
 
 		 578 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.48 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.48 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0300  gamma-glutamyltransferase  39.43 
 
 		 596 aa  280  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 587 aa  280  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  35.75 
 
 		 583 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  37.71 
 
 		 576 aa  279  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  35.08 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>