More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2100 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
340 aa  673    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  74.49 
 
 
341 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74.49 
 
 
341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  73.82 
 
 
340 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  73.75 
 
 
340 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  71.76 
 
 
340 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.94 
 
 
338 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.65 
 
 
338 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.37 
 
 
340 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.18 
 
 
338 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.78 
 
 
338 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  63.82 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  55.87 
 
 
349 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  56.6 
 
 
338 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.48 
 
 
347 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  54.42 
 
 
351 aa  358  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  52.42 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  50.74 
 
 
338 aa  318  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  51.17 
 
 
340 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.87 
 
 
349 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  48.82 
 
 
340 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.3 
 
 
345 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  50.87 
 
 
345 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  47.21 
 
 
338 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.99 
 
 
348 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  47.09 
 
 
347 aa  300  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.62 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.27 
 
 
346 aa  285  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.15 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.99 
 
 
347 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  42.27 
 
 
351 aa  272  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.27 
 
 
353 aa  269  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  43.87 
 
 
326 aa  253  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  39.36 
 
 
345 aa  236  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  34.47 
 
 
350 aa  182  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
422 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  37.82 
 
 
384 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  34.86 
 
 
355 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
389 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.06 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.84 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.58 
 
 
410 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.16 
 
 
392 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.98 
 
 
379 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.01 
 
 
444 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.25 
 
 
382 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.09 
 
 
405 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.81 
 
 
401 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.34 
 
 
351 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
346 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
351 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.74 
 
 
397 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.14 
 
 
347 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
380 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
410 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
389 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
346 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
388 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.65 
 
 
415 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.91 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
403 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 
401 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.16 
 
 
388 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.32 
 
 
389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
417 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.6 
 
 
425 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.6 
 
 
492 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 
384 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.73 
 
 
389 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
389 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  32.08 
 
 
346 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  39.85 
 
 
299 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.87 
 
 
389 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
404 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
344 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 
382 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
401 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.07 
 
 
401 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
401 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.15 
 
 
385 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
400 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
390 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.47 
 
 
389 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.55 
 
 
346 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.28 
 
 
384 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>