42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1138 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1138  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  332  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  37.29 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0726  hypothetical protein  47.5 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.24 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.24 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.24 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0672  hypothetical protein  47.67 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  49.52 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  34.76 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  38.68 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  42.45 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  36.89 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  40.24 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  42.67 
 
 		 198 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  38.16 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  34.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  39.32 
 
 		 484 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  38.78 
 
 		 521 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  42.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  33.64 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0744  hypothetical protein  39.53 
 
 		 126 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  48.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  42.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  42.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  46 
 
 		 1089 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  38.38 
 
 		 105 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  46 
 
 		 1093 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  46 
 
 		 1093 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  35.95 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  38.24 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2843  hypothetical protein  53.7 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  34.86 
 
 		 323 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  31.98 
 
 		 214 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  43.02 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  33.73 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  30.22 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  31.9 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30140  hypothetical protein  38.2 
 
 		 321 aa  41.2  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>