61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3030 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.278089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0517  hypothetical protein  49.75 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0974  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  34.3 
 
 		 413 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1513  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.63 
 
 		 424 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2703  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.86 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000043685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  28.68 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  27.92 
 
 		 403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.22 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2907  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  30.6 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  25.44 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  26.59 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  26.22 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  25 
 
 		 599 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  22.46 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.64 
 
 		 642 aa  63.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  27.34 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  25.34 
 
 		 634 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  24.55 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  23.74 
 
 		 641 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  25.98 
 
 		 601 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.07 
 
 		 613 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  26.16 
 
 		 618 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2049  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  27.17 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82123  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.58 
 
 		 600 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  21.98 
 
 		 639 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  20.16 
 
 		 561 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.91 
 
 		 613 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.21 
 
 		 636 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  22.76 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  24.76 
 
 		 640 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 649 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.52 
 
 		 596 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  23.55 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  20.93 
 
 		 608 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  23.44 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 667 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  21.77 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  23.35 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  23.15 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  25.83 
 
 		 481 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 		 615 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.22 
 
 		 603 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  27.38 
 
 		 605 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 		 603 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  24.14 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2249  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  22.19 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 605 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.83 
 
 		 596 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  25.43 
 
 		 615 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  24.78 
 
 		 623 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  25.96 
 
 		 615 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.01 
 
 		 604 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  24.89 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  26.82 
 
 		 617 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.14 
 
 		 603 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.5 
 
 		 650 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.61 
 
 		 644 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  20.59 
 
 		 480 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  22.54 
 
 		 615 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>