237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1556 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  48.36 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  50.42 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  41.05 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  40.82 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  46.24 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  44.66 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 849 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  33.82 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  41.94 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 938 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 750 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.53 
 
 		 797 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  36.67 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  34.09 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 824 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 		 817 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 		 872 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 833 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  37.84 
 
 		 795 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.6 
 
 		 833 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 740 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 795 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 797 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  38.55 
 
 		 724 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  31.4 
 
 		 839 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 818 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 740 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 835 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 838 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 806 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 786 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 1071 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  32.79 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 		 799 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 832 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  37.1 
 
 		 805 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 885 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 789 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 806 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 832 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 806 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.33 
 
 		 817 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  33.87 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  27.54 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  35 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  30 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  23.44 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.79 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  35.9 
 
 		 1063 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  35.9 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 732 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  26.76 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 709 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 801 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  32.31 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 816 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.79 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  29.51 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 1063 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  32.47 
 
 		 759 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 976 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 814 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 732 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  52.5 
 
 		 777 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 1021 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 758 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 1021 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  35.48 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 867 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 		 748 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  32.14 
 
 		 694 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  33.77 
 
 		 1013 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  27.4 
 
 		 830 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 734 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 889 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 		 797 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  27.54 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 876 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>