More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0460 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  100 
 
 
267 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  79.78 
 
 
266 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  63.98 
 
 
253 aa  344  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  64.75 
 
 
258 aa  341  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  59.19 
 
 
271 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  63.71 
 
 
254 aa  337  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  57.58 
 
 
271 aa  325  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  57.61 
 
 
280 aa  308  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.16 
 
 
263 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  38.35 
 
 
249 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 
275 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  37.12 
 
 
268 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 
257 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.11 
 
 
288 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  33.46 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  36.12 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  35.85 
 
 
267 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  36.43 
 
 
296 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  37.75 
 
 
290 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 
269 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.86 
 
 
275 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  35.46 
 
 
269 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 
305 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  35.32 
 
 
296 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  32.81 
 
 
259 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  37.65 
 
 
288 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  34.66 
 
 
261 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  32.43 
 
 
265 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  34.26 
 
 
261 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  34.66 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  34.66 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  34.26 
 
 
261 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  34.06 
 
 
296 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  32.17 
 
 
338 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  31.52 
 
 
271 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  32.91 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  33.73 
 
 
285 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  32.93 
 
 
262 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  32.71 
 
 
295 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
285 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  33.71 
 
 
281 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  34.57 
 
 
279 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  32.93 
 
 
262 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  33.73 
 
 
285 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  32.93 
 
 
262 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
285 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  33.45 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  33.07 
 
 
295 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.02 
 
 
259 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.25 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  36.03 
 
 
259 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  32.67 
 
 
295 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 
290 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  34.57 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  35.08 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  31.47 
 
 
271 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 
246 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  33.21 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 
259 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 
236 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  32.76 
 
 
305 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  29.03 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  34.14 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  34.21 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.78 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  34.63 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  33.72 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  31.84 
 
 
302 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  31.68 
 
 
273 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  33.2 
 
 
266 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  41.14 
 
 
289 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  46.27 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  29.43 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  37.41 
 
 
156 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  39.87 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  42.07 
 
 
252 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  41.38 
 
 
299 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  32.91 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  34.1 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  34.24 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  31.66 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  49.17 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  34.11 
 
 
239 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  27.85 
 
 
225 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.64 
 
 
248 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  26.46 
 
 
314 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  33.15 
 
 
287 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  28.41 
 
 
280 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 
241 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  28.69 
 
 
225 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  26.12 
 
 
315 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  25.18 
 
 
309 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  28.74 
 
 
272 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
323 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  28.69 
 
 
225 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  28.69 
 
 
225 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>