More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2177 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2177  cysteine synthase A  100 
 
 		 328 aa  649    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.82 
 
 		 322 aa  374  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  61.54 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  61.54 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.18 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.5 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  62.18 
 
 		 322 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 328 aa  352  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  61.49 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.68 
 
 		 327 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  60.52 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  62.14 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.97 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.35 
 
 		 319 aa  338  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.22 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  59.29 
 
 		 319 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  59.29 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  59.94 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.33 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  57.42 
 
 		 320 aa  331  9e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  61.9 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  59.49 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.09 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  59.35 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  58.1 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  59.37 
 
 		 322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  56.91 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  56.13 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.89 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  60.26 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  55.81 
 
 		 313 aa  325  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  60.58 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  55.52 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  54.84 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1794  cysteine synthase  58.41 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000492441  normal  0.123745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  57.98 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  58.09 
 
 		 322 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  55.48 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  57.1 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  56.75 
 
 		 326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.25 
 
 		 310 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  58.63 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  56.35 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  54.19 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  56.45 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  52.94 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  54.66 
 
 		 320 aa  308  9e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  58.84 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.87 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  53.09 
 
 		 311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  55.52 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  58.31 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.42 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  58.31 
 
 		 334 aa  305  6e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  57.42 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  52.12 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.9 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  58.58 
 
 		 308 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.27 
 
 		 310 aa  301  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  57.1 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  52.13 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  54.19 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  53.75 
 
 		 308 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  55.05 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  52.92 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  53.23 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  54.19 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  53.92 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  55.81 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  53.75 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  48.23 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  54.79 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.42 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  54.19 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  54.19 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  50.97 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  49.51 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  54.66 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  52.75 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  54.07 
 
 		 309 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.37 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  52.75 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  53.65 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  52.77 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  55.31 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  52.27 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.84 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>