More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0705 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  52.78 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  38.57 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  39.86 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  42.97 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  36.88 
 
 		 142 aa  93.6  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  38.13 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  37.86 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  41.55 
 
 		 177 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  42.55 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  38.85 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  38.13 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  36.81 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  39.72 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  36.96 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  36.96 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  37.78 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  35.97 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  39.72 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  38.13 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  36.62 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  34.03 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  36.69 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  38.52 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  34.07 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  33.09 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.01 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  39.01 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  37.68 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.06 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  33.57 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  35.46 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.23 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  40 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  34.07 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  35.33 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  32.14 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.87 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  33.55 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  31.08 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  31.47 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  36.89 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  33.78 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  39.2 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  37.8 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  37.8 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  34.65 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  33.77 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  42.34 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  32.24 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.42 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  32.89 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  32.89 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  32.89 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.89 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.81 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.77 
 
 		 628 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2688  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.4 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.81 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  29.86 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  33.79 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>