46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0386 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  46.51 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  30.2 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  32.83 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  29.59 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  28.89 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  32.8 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  29.6 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  28.83 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  33.59 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  33.59 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  37.27 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  29.29 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  32.4 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  30.85 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  31.73 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  28.28 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  27.34 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  27.11 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  29.84 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  29.02 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  33.15 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  31.44 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  26.24 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  22.01 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  28.19 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  32.79 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  32.79 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  32.79 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  28.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  28.06 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  31.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  27.46 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  26.09 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  26.51 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4061  hypothetical protein  41.03 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  29.8 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.36 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  26.47 
 
 		 564 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>