More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4853 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  100 
 
 		 330 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  77.39 
 
 		 331 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  76.97 
 
 		 336 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  75.64 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  76.87 
 
 		 335 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  75.64 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  75.64 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  74.18 
 
 		 331 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  73.4 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  73.7 
 
 		 318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  67.3 
 
 		 361 aa  424  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 319 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  65.92 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  67.88 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  64.04 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  66.01 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  68.87 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  63.99 
 
 		 313 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  69.35 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  63.28 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  63.93 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  63.46 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  60.74 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  67.63 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  63.55 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  63.31 
 
 		 332 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  62.3 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  59.74 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  62.66 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  64.59 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  63.16 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  63.46 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  62.93 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  58.33 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  59.28 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  57.32 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  62.7 
 
 		 329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  62.14 
 
 		 325 aa  358  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  57.52 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.62 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  58.23 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.3 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.3 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  63.12 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  53.46 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  57.23 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.79 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.62 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53.5 
 
 		 311 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 311 aa  328  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.64 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.15 
 
 		 311 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.79 
 
 		 311 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  53.4 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.32 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50 
 
 		 311 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  49.85 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  50.44 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.08 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.41 
 
 		 339 aa  316  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 345 aa  315  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  52.29 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  48.53 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  48.55 
 
 		 352 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50.98 
 
 		 321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  51.92 
 
 		 314 aa  311  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  49.03 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.53 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  50.62 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  50.62 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  50.62 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  50.62 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  48.45 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.4 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  48.74 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  50.62 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2209  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  48.23 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 456 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  50.31 
 
 		 321 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  48.73 
 
 		 322 aa  308  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.9 
 
 		 335 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  49.18 
 
 		 314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>