More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3952 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  69.57 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  70.4 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  70.4 
 
 		 254 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  70.4 
 
 		 254 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  71.03 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  71.03 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  71.03 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  70.12 
 
 		 269 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  73.82 
 
 		 237 aa  350  8.999999999999999e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  69.72 
 
 		 270 aa  349  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  72.53 
 
 		 237 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  69.32 
 
 		 270 aa  343  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  68.95 
 
 		 270 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  68.95 
 
 		 270 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  68.95 
 
 		 270 aa  341  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  70.12 
 
 		 269 aa  340  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  62.35 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  60.24 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  60.24 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  65.27 
 
 		 265 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  61.94 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  64.05 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  64.44 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  58.8 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  60.24 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  60.24 
 
 		 266 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  60.24 
 
 		 266 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  60.24 
 
 		 266 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  60.89 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  59.84 
 
 		 269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  58.06 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  59.35 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  57.31 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  57.14 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  64.05 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  64.05 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  64.05 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  62.25 
 
 		 255 aa  258  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  51.91 
 
 		 285 aa  254  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  52.1 
 
 		 250 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  53.78 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  53.57 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  52.26 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  46.86 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  50.43 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  51.15 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  47.5 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  44.59 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  43.89 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  42.08 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  45.29 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  38.59 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  48.11 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  38.33 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  55.56 
 
 		 141 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  39.61 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  34.26 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11994  integral membrane protein YrbE3a  53.7 
 
 		 132 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  41.62 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  30.28 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.73 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  36.89 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  36.13 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  32.14 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  32.14 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  30.34 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29.2 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  36.81 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.78 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  33.65 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.39 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  29.96 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  32.39 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  34.73 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  30.41 
 
 		 430 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  33.15 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  33.99 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  32.66 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  32.58 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.45 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  30.08 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  28.81 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  29.31 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  33.65 
 
 		 387 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  28.39 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.35 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  29.54 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.47 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  30.54 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  29.36 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.63 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5634  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  54.46 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>