More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3897 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3897  cytochrome P450  100 
 
 		 403 aa  772    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5543  cytochrome P450  48.28 
 
 		 391 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0230136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.71 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.14 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.05 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  37.76 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.34 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.6 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.89 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.9 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.9 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.34 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.34 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.64 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  35.09 
 
 		 447 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  35.09 
 
 		 447 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  40.79 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.01 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.92 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.18 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  35.7 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.92 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.37 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.81 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  40.18 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.73 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  36.59 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.37 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  29.53 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.96 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.11 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.97 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.38 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.84 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.59 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.22 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.8 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.59 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  36.39 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  33.16 
 
 		 409 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.57 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.68 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  29.81 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.34 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  38.2 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  32.81 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.68 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  34.27 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  36.03 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.08 
 
 		 411 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.74 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.52 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.23 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  32.27 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.15 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.55 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  32.27 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  32.27 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.38 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.81 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  37.99 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  38.65 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  29.49 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.25 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  37.61 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  34.55 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.78 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  29.44 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  38.08 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  31.42 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  36.06 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  30.63 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  33.43 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  33.03 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.09 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.58 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32.15 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.89 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  33.86 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  30.86 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  31.89 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  32.35 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.78 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  33.8 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  30.23 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  37.69 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.06 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.56 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  34.38 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  30.63 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  30.79 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  34.67 
 
 		 421 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  33.84 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.82 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.52 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  32.77 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.46 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  31.87 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  29.72 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  32.88 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>