More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2337 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  77.93 
 
 
431 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
436 aa  868    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  75.06 
 
 
437 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  76.29 
 
 
427 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  74.24 
 
 
430 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  77.93 
 
 
431 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  77.93 
 
 
431 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  75.75 
 
 
442 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  70.4 
 
 
431 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  70.23 
 
 
433 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  63.08 
 
 
435 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.94 
 
 
428 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  62.97 
 
 
428 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.29 
 
 
433 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  60.65 
 
 
433 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  59.21 
 
 
431 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  59.72 
 
 
425 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  59.72 
 
 
425 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  55.2 
 
 
449 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  58.41 
 
 
432 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.31 
 
 
437 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.08 
 
 
429 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  58.89 
 
 
430 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  57.97 
 
 
432 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  58.1 
 
 
431 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  58.43 
 
 
458 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  56.67 
 
 
451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.94 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  57.93 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  54.5 
 
 
462 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  56.81 
 
 
446 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  55.97 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  55.25 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  55.92 
 
 
454 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  52.47 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  53.85 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  44.55 
 
 
431 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.04 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.15 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.15 
 
 
436 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.8 
 
 
425 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.51 
 
 
425 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.28 
 
 
441 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.96 
 
 
424 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  42.72 
 
 
423 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  44.9 
 
 
431 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.02 
 
 
429 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.46 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.52 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.9 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.58 
 
 
425 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.07 
 
 
424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.19 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  41.33 
 
 
436 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  39.51 
 
 
426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.61 
 
 
431 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.04 
 
 
422 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.09 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.37 
 
 
433 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.45 
 
 
425 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.89 
 
 
430 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  40.21 
 
 
426 aa  298  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.78 
 
 
430 aa  296  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4891  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.36 
 
 
447 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0481803  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.11 
 
 
425 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.05 
 
 
430 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.92 
 
 
434 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.71 
 
 
428 aa  292  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.8 
 
 
442 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.08 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.03 
 
 
435 aa  289  9e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  41.08 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.83 
 
 
428 aa  285  8e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  39.02 
 
 
430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.03 
 
 
437 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  38.56 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.29 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  37.95 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.58 
 
 
422 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.04 
 
 
434 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  40.71 
 
 
428 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.03 
 
 
473 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.86 
 
 
432 aa  277  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  38.4 
 
 
425 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  37.87 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  41.71 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.03 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.03 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.65 
 
 
447 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.21 
 
 
431 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  40.83 
 
 
427 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  38.8 
 
 
433 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  38.76 
 
 
428 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  40.15 
 
 
433 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  38.76 
 
 
428 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  41.72 
 
 
426 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  41.71 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  39.02 
 
 
428 aa  263  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.74 
 
 
430 aa  262  8.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>