More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2130 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  100 
 
 		 464 aa  942    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  60.48 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  61.35 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  59.96 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  57.77 
 
 		 470 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  57.77 
 
 		 470 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  57.77 
 
 		 470 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.77 
 
 		 469 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  53.66 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.96 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  52.6 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  53.12 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.71 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  48.32 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  46.98 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.19 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  45.63 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.88 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  47.51 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.24 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.6 
 
 		 462 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.85 
 
 		 488 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.15 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.79 
 
 		 528 aa  236  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.68 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.68 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  33.55 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  33.76 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.68 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.47 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  34.81 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  34.18 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.12 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  33.19 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  33.97 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  33.83 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  33.55 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.48 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.48 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  32.48 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  32.48 
 
 		 590 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  32.48 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  32.9 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  32.27 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.76 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  29.87 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  33.91 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  31.84 
 
 		 459 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  31.84 
 
 		 459 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  31.84 
 
 		 459 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.17 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  32.59 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  32.24 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.47 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  32.68 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.46 
 
 		 469 aa  203  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  31.18 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 475 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.89 
 
 		 767 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  32.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  32.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  32.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  32.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  32.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  32.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  33.48 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.03 
 
 		 745 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  34.75 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  31.38 
 
 		 475 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  30.94 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.61 
 
 		 469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  31.82 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.8 
 
 		 546 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  32.51 
 
 		 767 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.43 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.33 
 
 		 456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  31.85 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  29.78 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.91 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  30.79 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  32.4 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.62 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.7 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  32.24 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  31.47 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  31.47 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  29.58 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  29.85 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.95 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  32.69 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  31.79 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>