More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1562 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  74.24 
 
 		 482 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  100 
 
 		 477 aa  959    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  58.03 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  56.64 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  56.64 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  56.64 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  39.53 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  38.94 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  38.54 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  38.55 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  43.29 
 
 		 621 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  31.94 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  30.73 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  34.48 
 
 		 481 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  31.36 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  33.33 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  31.06 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  30.18 
 
 		 614 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  29.54 
 
 		 603 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  29.54 
 
 		 603 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  28.7 
 
 		 607 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  26.35 
 
 		 558 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  31.44 
 
 		 630 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  27.73 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.15 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  28.45 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  27.79 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  27.64 
 
 		 518 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  25.42 
 
 		 494 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.39 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  27.65 
 
 		 576 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  26.88 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  26.65 
 
 		 524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  24.44 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.49 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  27.14 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  27.14 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  25.75 
 
 		 624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  23.89 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  24.54 
 
 		 586 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  27.37 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  27.04 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  27.65 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  24.08 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.98 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.25 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  26.6 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  26.06 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.26 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  21.69 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  26.45 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  25 
 
 		 519 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  26.97 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  28.38 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  26.76 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  29.4 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.89 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  26.27 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27.5 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3641  sulfatase  29.6 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  22.1 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  25.05 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  27.17 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  23.4 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.43 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  24.77 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  25.1 
 
 		 503 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  26.51 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  31.4 
 
 		 766 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  22.49 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  28.48 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  28.2 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.89 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  26.36 
 
 		 505 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  24.84 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  24.22 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  24.22 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  24.22 
 
 		 497 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  26.81 
 
 		 476 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  24.22 
 
 		 497 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.54 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  26.44 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  26.09 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  24.84 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  26.45 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  25.26 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  26.95 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  22.75 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  25.61 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  26.1 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  26.65 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  26.11 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  24.48 
 
 		 493 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  23.38 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  26.73 
 
 		 503 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  22.31 
 
 		 526 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  24.27 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  26.58 
 
 		 520 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  26.84 
 
 		 486 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>